菌種是用于發(fā)酵過(guò)程中作為活細胞催化劑的微生物，是指食用菌、工業(yè)菌、農用菌菌絲體及其生長(cháng)基質(zhì)組成的繁殖材料，其中包括細菌、放線(xiàn)菌、酵母菌和霉菌四大類(lèi)。菌株是一種菌類(lèi)系列中一個(gè)品種，表示同種微生物不同來(lái)源的純種培養，從自然界中分離得到的每一個(gè)微生物純培養都可稱(chēng)一個(gè)菌株。
一、菌種是什么
1、菌種是指一組由相同菌屬、菌種命名的單一或分枝鏈單一紫菌綱細胞形態(tài)和遺傳特征相似的細菌總稱(chēng)。菌株則指在同一菌種下，由不同的來(lái)源（不同的患者、不同的環(huán)境，在不同的時(shí)間或地點(diǎn)分離出的）而分離出的，具有明顯特征差異的亞種。
2、菌種是從事微生物學(xué)及生命科學(xué)研究的基本材料，在醫學(xué)領(lǐng)域中，診斷制品的制備，菌苗的生產(chǎn)、微生物致病性研究、藥物的抑菌試驗、藥品微生物檢驗等方面都有一套完整的菌種，菌種又分為母種、原種以及栽培種三級。
二、主要區別
1. 定義不同
菌種和菌株的定義不同，菌種是按照分類(lèi)學(xué)上的規定按照一定的科學(xué)標準來(lái)定義，而菌株則是根據臨床或科研實(shí)驗需要，將同一菌種中表現出顯著(zhù)性狀差異的菌體分為不同次級群體。
2. 特征不同
同一菌種之間可以有很大的表型和基因型的差異，因此，菌株之間也會(huì )存在很多差異，或者在進(jìn)行各類(lèi)實(shí)驗和應用時(shí)，選擇具有特殊性狀的分離物。
3. 應用范圍不同
菌株主要用于臨床和實(shí)驗室應用等方面，如藥物敏感性試驗、免疫診斷、研究微生物生態(tài)學(xué)、基因工程及發(fā)酵工業(yè)等方面。菌種則主要用于微生物學(xué)研究中，較少直接應用。
4、實(shí)際應用
在實(shí)際應用中，菌株和菌種的概念有時(shí)候也會(huì )有所關(guān)聯(lián)。比如，一些研究人員會(huì )選擇不同來(lái)源的菌株作為同一菌種的代表，以構建菌種的典型菌株集合，為了便于分類(lèi)鑒定，常常會(huì )存放在菌種庫中。
5、總結
綜上所述，菌種和菌株雖然在概念上存在一定的差異，但在微生物的研究和應用中，卻又常常密切關(guān)聯(lián)?？蒲腥藛T在應用中要嚴格根據概念區分，避免混淆誤用。
三、菌群、菌型、菌屬是什么
1、菌群：指的是大量真菌或細菌形成肉眼可見(jiàn)的集團，生活在健康動(dòng)物各部位、數量大、種類(lèi)較穩定、一般能發(fā)揮有益作用的微生物種群叫正常菌群。
2、菌型：同一菌種的不同細菌，在某些方面有較小差異的為同一菌型，通常一個(gè)菌種內的細菌可以分為多種不同的菌型。
3、菌屬：菌種的上一級分類(lèi)，通常性狀相近、親緣關(guān)系密切的若干菌種組成一個(gè)菌屬，如芽孢桿菌屬、葡萄球菌屬、乳桿菌屬等。
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